sevenbridges

DOI:10.18129 / B9.bioc.sevenbridges

这是发展sevenbridges版本;稳定的发布版本,请参阅sevenbridges。

七桥平台API客户机和通用工作流语言工具构建器在R

Bioconductor版本:发展(3.18)

R客户机和公用事业七桥平台API,从癌症基因组学云其他七桥支持平台。

作者:菲尔·韦伯斯特(aut (cre),儿子Koc (aut),南肖(aut)腾飞阴(aut),科维奇Randjelovic[所有],埃米尔年轻[所有],Velsera (cph,曾经)

维修工:菲尔·韦伯斯特<菲尔。韦伯斯特在velsera.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“sevenbridges”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sevenbridges”)

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HTML	R脚本	描述和执行CWL工具/ R中的工作流
HTML	R脚本	发现公司治理文化通过浏览器的数据和数据集的数据API
HTML	R脚本	IDE容器:RStudio服务器,闪亮的服务器,等等
HTML	R脚本	癌症基因组学大师教程:使用R云
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,软件,ThirdPartyClient
版本	1.31.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(7年)
许可证	Apache 2.0许可|文件许可证
取决于	方法,跑龙套,统计数据
进口	httr、jsonlite yaml、objectProperties stringr,S4Vectorsdocopt,旋度、uuid data.table
链接
建议	knitr、rmarkdown testthat readr
SystemRequirements
增强了
URL	https://www.sevenbridges.comhttps://sbg.github.io/sevenbridges-r/https://github.com/sbg/sevenbridges-r
BugReports	https://github.com/sbg/sevenbridges-r/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sevenbridges_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	sevenbridges_1.31.0.zip
macOS二进制(x86_64)	sevenbridges_1.31.0.tgz
macOS二进制(arm64)	sevenbridges_1.31.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sevenbridges
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sevenbridges
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/sevenbridges/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sevenbridges/
包下载报告	下载数据