seqPattern

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqPattern

这是发展seqPattern版本;稳定的发布版本,请参阅seqPattern。

想象寡核苷酸模式和主题出现跨一组排序序列

Bioconductor版本:发展(3.13)

想象寡核苷酸序列模式和主题出现在大量的序列集中在一个共同的参考点和按用户定义的排序功能。

作者:Vanja Haberle < Vanja。在gmail.com haberle >

维护人员:Vanja Haberle < Vanja。在gmail.com haberle >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“seqPattern”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“seqPattern”)

PDF	R脚本	seqPattern
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	SequenceMatching,软件,可视化
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	方法,R (> = 2.15.0)
进口	Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix
链接
建议	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,篮球选手,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我	genomation
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	seqPattern_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	seqPattern_1.23.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	seqPattern_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqPattern
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ seqPattern
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqPattern/
包下载报告	下载数据