seqcna

doi:10.18129/b9.bioc.seqcna

这是发展Seqcna的版本;对于稳定版本,请参阅seqcna

高通量测序癌症数据的拷贝数分析

生物导体版本:开发(3.16)

通过快速汇总,广泛的过滤和改善归一化的高通量测序癌症数据的拷贝数分析

作者:David Mosen-Ansorena

维护者:David Mosen-Ansorena

引用(从r内,输入引用(“ seqcna”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ seqccn”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ seqcna”)

PDF R脚本 seqcna.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 库务,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件
版本 1.43.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(8。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.0),高兴的(> = 2.14),Dosnow(> = 1.0.5),Adehabitatlt(> = 0.3.4),seqcna.annot(> = 0.99),方法
进口
链接
建议
系统要求 Samtools
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 赫珀
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqcna_1.43.0.tar.gz
Windows二进制 seqcna_1.43.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) seqcna_1.43.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqcna
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqcna
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/seqcna/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网