这是发展Seqcna的版本;对于稳定版本,请参阅seqcna。
生物导体版本:开发(3.16)
通过快速汇总,广泛的过滤和改善归一化的高通量测序癌症数据的拷贝数分析
作者:David Mosen-Ansorena
维护者:David Mosen-Ansorena
引用(从r内,输入引用(“ seqcna”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ seqccn”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ seqcna”)
R脚本 | seqcna.pdf | |
参考手册 |
生物浏览 | 库务,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.43.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(8。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.0),高兴的(> = 2.14),Dosnow(> = 1.0.5),Adehabitatlt(> = 0.3.4),seqcna.annot(> = 0.99),方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | Samtools |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 赫珀 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | seqcna_1.43.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqcna_1.43.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | seqcna_1.43.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqcna |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqcna |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqcna/ |
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