seqcat
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doi：10.18129/b9.bioc.seqcat
这是发展Seqcat的版本;对于稳定版本，请参阅seqcat。
高通量测序单元验证工具包
生物导体版本：开发（3.16）
SEQCAT软件包使用来自高吞吐量测序技术的变体调用数据（以VCF文件的形式）来验证和验证科学努力中使用的生物样品的源，功能和特征。
作者：埃里克·弗斯特里乌斯[AUT，CRE]
维护者：erik prasterius
引用（从r内，输入引用（“ seqcat”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ seqcat”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ seqcat”）
| html | R脚本 | seqcat：高吞吐量测序单元验证工具包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 覆盖范围，，，，基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，变体 |
| 版本 | 1.19.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
| 要看 | r（> = 3.6），基因组机（> = 1.26.4），变体（> = 1.20.3） |
| 进口 | dplyr（> = 0.5.0），GenomeInfodB（> = 1.13.4），GGPLOT2（> = 2.2.1），网格（> = 3.5.0），iranges（> = 2.8.2），方法，rtracklayer，，，，rlang，，，，秤（> = 0.4.1），S4VECTORS（> = 0.12.2），统计总结性特征（> = 1.4.0），花花公子（> = 0.6.1），UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物管理器 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | seqcat_1.19.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqcat_1.19.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | seqcat_1.19.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqcat |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqcat |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqcat/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
