烤饼

doi：10.18129/b9.bioc.scone

这是发展Scone的版本；对于稳定版本，请参阅烤饼。

归一化表达数据的单元单元概述

生物导体版本：开发（3.14）

Scone是一个R包，用于比较和对单细胞RNA-SEQ和其他高通量分析的不同归一化方案的性能进行比较和排名。

作者：Michael Cole [AUT，CPH]，Davide Risso [AUT，CRE，CPH]，Matteo Borella [CTB]，Chiara Romualdi [CTB]

维护者：davide risso

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）biocmanager :: install（scone'scount（“ scone”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Scone”）

html	R脚本	Scone简介
html	R脚本	psinorm归一化
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，正常化，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.17.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（4年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.4），方法，总结性特征
进口	图形，统计，utils，香气，，，，生物比较，，，，班级，，，，簇，，，，组成，，，，diptest，，，，EDGER，，，，FPC，，，，GPLOTS，grdevices，Hexbin，，，，林玛，，，，矩阵，，，，混音工具，，，，rcolorbrewer，，，，引导，，，，RHDF5，，，，Ruvseq，，，，rarpack，，，，矩阵，，，，Singlecellexperiment
链接
建议	生物使用，，，，DT，，，，GGPLOT2，，，，尼特，，，，miniui，，，，NMF，，，，情节，，，，RESHAPE2，，，，rmarkDown，，，，斯克兰，scrnaseq，闪亮的，，，，测试，，，，Visnetwork，，，，多帕尔，，，，batchjobs，，，，飞溅，，，，评分，，，，KableExtra，，，，mclust
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/yoseflab/scone/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scone_1.17.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	scone_1.17.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/scone
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/scone/
软件包下载报告	下载统计