Schex.

DOI:10.18129 / b9.bioc.schex.

这是发展Schex的版本;对于稳定的版本版本,请参阅Schex.

单级小区常规数据的六英寸图

Bioconducts版本:开发(3.14)

为变量和尺寸减少构建六边形图,存储在单个小区OMICS数据中,例如SingleCellexPeriment和SeuratObject。本套餐中使用的想法是基于Dan Carr,Nicholas Lewin-Koh,Martin Maechler和Thomas Lumley的优秀工作。

作者:Saskia Freytag

维护者:Saskia Freytag

引文(从R内,输入引文(“Schex”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!carcenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)#下面初始化buoc devel biocmanager :: install的使用(版本='devel')biocmanager ::安装(“schex”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“Schex”)

HTML. r script. multi_modal_schex.
HTML. r script. picking_the_right_resolution.
HTML. r script. seurat_schex.
HTML. r script. Shiny_schhex.
HTML. r script. 使用_schex.
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 尺寸减少测序SingleCell.软件可视化
版本 1.7.0
在生物导体中以来 BIOC 3.10(R-3.6)(1.5年)
执照 GPL-3
依靠 SinglecellexPeriment.(> = 1.7.4),Seurat.ggplot2.(> = 3.2.1),闪亮的
进口 六己,统计,方法,dplyr.Ggforce., 网格,骨负
链接到
建议 GGRepel.knRAMAMAMDOW.testthat.(> = 2.1.0),Covr.tenxpbmcdata.撒尿Shinydashboard我懂了iGraph.
系统要求
加强
URL. https://github.com/saskiafreytag/schex.
Bugreports. https://github.com/saskiafreytag/schex/issues.
取决于我
进口我 SCTERSOR.SCTGIF.
建议我 FCOEX.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 Schex_1.7.0.tar.gz.
Windows二进制文件 Schex_1.7.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) Schex_1.7.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/schex.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/ schex
包短网址 https://biocumon.org/packages/schex/
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