这是发展Schex的版本;对于稳定的版本版本,请参阅Schex.。
Bioconducts版本:开发(3.14)
为变量和尺寸减少构建六边形图,存储在单个小区OMICS数据中,例如SingleCellexPeriment和SeuratObject。本套餐中使用的想法是基于Dan Carr,Nicholas Lewin-Koh,Martin Maechler和Thomas Lumley的优秀工作。
作者:Saskia Freytag
维护者:Saskia Freytag
引文(从R内,输入引文(“Schex”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!carcenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)#下面初始化buoc devel biocmanager :: install的使用(版本='devel')biocmanager ::安装(“schex”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“Schex”)
HTML. | r script. | multi_modal_schex. |
HTML. | r script. | picking_the_right_resolution. |
HTML. | r script. | seurat_schex. |
HTML. | r script. | Shiny_schhex. |
HTML. | r script. | 使用_schex. |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 尺寸减少那测序那SingleCell.那软件那可视化 |
版本 | 1.7.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.10(R-3.6)(1.5年) |
执照 | GPL-3 |
依靠 | SinglecellexPeriment.(> = 1.7.4),Seurat.那ggplot2.(> = 3.2.1),闪亮的 |
进口 | 六己,统计,方法,簇那dplyr.那熵那Ggforce.那秤, 网格,骨负 |
链接到 | |
建议 | GGRepel.那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.(> = 2.1.0),Covr.那tenxpbmcdata.那撒尿那Shinydashboard那我懂了那iGraph.那斯 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/saskiafreytag/schex. |
Bugreports. | https://github.com/saskiafreytag/schex/issues. |
取决于我 | |
进口我 | SCTERSOR.那SCTGIF. |
建议我 | FCOEX. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | Schex_1.7.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | Schex_1.7.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | Schex_1.7.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/schex. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包装/ schex |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/schex/ |
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