scTHI

DOI:10.18129 / B9.bioc.scTHI

这是发展scTHI版本;稳定的发布版本,请参阅scTHI。

识别中的显著激活交互跨集群的细胞RNA从单细胞测序数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

scTHI R包来识别活跃对从单个细胞中的为了研究,其中,tumor-host交互。scTHI签名包含一组对肿瘤微环境细胞进行分类。

作者:弗朗西斯卡Pia卡鲁索(aut),米歇尔·切(aut (cre)

维修工:米歇尔·切< m。切在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“scTHI”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	使用scTHI
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细节

biocViews	SingleCell,软件
版本	1.11.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0)
进口	BiocParallel,RtsnegrDevices图形,统计数据
链接
建议	scTHI.data,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/miccec/scTHI/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scTHI_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	scTHI_1.11.0.zip
macOS二进制(x86_64)	scTHI_1.11.0.tgz
macOS二进制(arm64)	scTHI_1.11.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTHI
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scTHI
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/scTHI/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scTHI/
包下载报告	下载数据