- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- scTGIF(开发版)
scTGIF
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DOI:10.18129 / B9.bioc.scTGIF
这是发展scTGIF版本;稳定的发布版本,请参阅scTGIF。
细胞类型为未经单细胞RNA-Seq数据注释
Bioconductor版本:发展(3.17)
scTGIF连接相关的细胞和基因功能的细胞类型标签。
作者:露崎引人入胜(aut (cre)
维护人员:< k.t露崎引人入胜。答案在hotmail.co.jp >
从内部引用(R,回车引用(“scTGIF”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“scTGIF”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“scTGIF”)
| HTML | R脚本 | scTGIF |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DimensionReduction,GeneExpression,质量控制,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.13.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(3年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0) |
| 进口 | GSEABase,Biobase,SingleCellExperiment,BiocStyle,情节,tagcloud,rmarkdown,RcppgrDevices,图形,跑龙套,knitr,S4Vectors,SummarizedExperiment,RColorBrewer,nnTensor、方法、尺度,msigdbr,schex,宠物猫,ggplot2,igraph |
| 链接 | |
| 建议 | testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | scTensor |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | scTGIF_1.13.0.tar.gz |
| Windows二进制 | scTGIF_1.13.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | scTGIF_1.13.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | scTGIF_1.13.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTGIF |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scTGIF |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/scTGIF/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scTGIF/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
