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doi：10.18129/b9.bioc.screcover

这是发展Screcover的版本；对于稳定版本，请参阅滚动。

单细胞RNA-seq数据的插图

生物导体版本：开发（3.16）

Screcover是用于插入单细胞RNA-Seq（SCRNA-SEQ）数据的R软件包。它将在SCRNA-SEQ RAW读取计数矩阵中检测并算力辍学值，同时保持真实的零不变，因为SCRNA-SEQ数据中都有辍学零和真实零。通过与Scimpute，Saver和Magic结合使用，Scrocover不仅可以以更高的精度检测辍学和真实零，而且还可以改善下游聚类和可视化结果。

作者：Zhun Miao，Xuegong Zhang

维护者：zhun miao

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ screcover”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Scrocover”）

html	R脚本	滚动
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3年）
执照	GPL
要看	R（> = 3.4.0）
进口	统计，utils，方法，图形，多帕尔，，，，foreach， 平行，受到惩罚，，，，克恩拉布，，，，RSVD，，，，矩阵（> = 1.2-14），大量的（> = 7.3-45），PSCL（> = 1.4.9），BBMLE（> = 1.0.18），gamlss（> = 4.4-0），PRESEQR（> = 4.0.0），储蓄者（> = 1.1.1），rmagic（> = 1.3.0），生物比较（> = 1.12.0）
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，Singlecellexperiment，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://miaozhun.github.io/screcover
BugReports	https://github.com/miaozhun/screcover/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	screcover_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	screcover_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	screcover_1.13.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/screcover
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/scrocover
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/screcover/
软件包下载报告	下载统计