这是发展Schot的版本;对于稳定版本,请参阅Schot。
生物导体版本:开发(3.16)
单细胞高阶测试(SCHOT)是一个R封装,可促进沿发育轨迹或跨空间的基因表达高阶结构的测试变化。Schot本质上是一般的,并且可以在多个数据上下文中运行,例如沿着连续轨迹,离散组之间和空间方向过度运行。以及适应任何高阶测量值,例如可变性或相关性。SCHOT有意义地添加了一阶效应测试,例如差异表达,并提供了一个框架来询问单细胞数据的高阶相互作用。
作者:Shila Ghazanfar [AUT,CRE],Yingxin lin [aut]
维护者:shila ghazanfar
引用(从r内,输入引用(“ Schot”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ schot”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Schot”)
html | R脚本 | 入门:Schot |
参考手册 |
生物浏览 | 基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | S4VECTORS(> = 0.24.3),Singlecellexperiment,,,,矩阵,,,,总结性特征,,,,iranges,方法,统计,生物比较,,,,重塑,,,,GGPLOT2,,,,Igraph,grdevices,GGFORCE,图形 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,降价,,,,rmarkDown,,,,评分,,,,散点,,,,秤,,,,矩阵,,,,Deldir |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | schot_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | schot_1.9.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | schot_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/schot |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/schot |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/schot/ |
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