Schot

doi:10.18129/b9.bioc.schot

这是发展Schot的版本;对于稳定版本,请参阅Schot

单细胞高阶测试

生物导体版本:开发(3.16)

单细胞高阶测试(SCHOT)是一个R封装,可促进沿发育轨迹或跨空间的基因表达高阶结构的测试变化。Schot本质上是一般的,并且可以在多个数据上下文中运行,例如沿着连续轨迹,离散组之间和空间方向过度运行。以及适应任何高阶测量值,例如可变性或相关性。SCHOT有意义地添加了一阶效应测试,例如差异表达,并提供了一个框架来询问单细胞数据的高阶相互作用。

作者:Shila Ghazanfar [AUT,CRE],Yingxin lin [aut]

维护者:shila ghazanfar

引用(从r内,输入引用(“ Schot”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ schot”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Schot”)

html R脚本 入门:Schot
PDF 参考手册

细节

生物浏览 基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 4.0)
进口 S4VECTORS(> = 0.24.3),Singlecellexperiment,,,,矩阵,,,,总结性特征,,,,iranges,方法,统计,生物比较,,,,重塑,,,,GGPLOT2,,,,Igraph,grdevices,GGFORCE,图形
链接
建议 尼特,,,,降价,,,,rmarkDown,,,,评分,,,,散点,,,,,,,,矩阵,,,,Deldir
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 schot_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 schot_1.9.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) schot_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/schot
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/schot
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/schot/
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