scFeatureFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.scFeatureFilter

这是发展scFeatureFilter的版本;稳定版请参见scFeatureFilter．

一种基于相关的单细胞RNAseq数据质量滤波方法

Bioconductor版本:开发(3.17)

Joshi实验室开发的基于相关性的方法的R实现，用于分析和过滤处理过的单细胞RNAseq数据。它返回数据的过滤版本，仅包含不受系统噪声影响的基因表达值。

作者:Angeles Arzalluz-Luque [aut]， Guillaume Devailly [aut, cre]， Anagha Joshi [aut]

维护者:Guillaume Devailly

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("scFeatureFilter")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scFeatureFilter”)

超文本标记语言	R脚本	介绍scFeatureFilter
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，ImmunoOncology，预处理，RNASeq，SingleCell，软件
版本	1.19.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)
进口	dplyr(> = 0.7.3),ggplot2(> =魅惑,magrittr(> = 1.5),rlang(> = 0.1.2),宠物猫(>= 1.3.4)，统计，方法
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，scRNAseq，cowplot
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scFeatureFilter_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	scFeatureFilter_1.19.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	scFeatureFilter_1.19.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	scFeatureFilter_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scFeatureFilter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scFeatureFilter
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/scFeatureFilter/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scFeatureFilter/
软件包下载报告	下载数据