- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- sangerseqR(开发版)
sangerseqR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.sangerseqR
这是发展sangerseqR版本;稳定的发布版本,请参阅sangerseqR。
工具在R Sanger测序数据
Bioconductor版本:发展(3.16)
这个包包含几个工具分析R Sanger测序数据文件,包括阅读.scf和.ab1文件,使basecalls和图绘制色谱图。
作者:乔纳森·t·希尔,布拉德利Demarest
乔纳森·希尔在byu.edu < jhill维护者:>
从内部引用(R,回车引用(“sangerseqR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“sangerseqR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“sangerseqR”)
| R脚本 | sangerseqR | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 单核苷酸多态性,测序,软件,可视化 |
| 版本 | 1.33.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(8.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.0.2),Biostrings |
| 进口 | 方法,闪亮的 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | sangeranalyseR |
| 进口我 | scif里面 |
| 建议我 | CrispRVariants |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | sangerseqR_1.33.0.tar.gz |
| Windows二进制 | sangerseqR_1.33.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | sangerseqR_1.33.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | sangerseqR_1.33.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangerseqR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sangerseqR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sangerseqR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
