runibic

DOI:10.18129 / B9.bioc.runibic

这是发展runibic版本;稳定的发布版本,请参阅runibic。

runibic:基于行的biclustering算法在R基因表达数据的分析

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包实现了UbiBic算法在r . biclustering基因表达数据的分析算法是Zhenjia王等人2016年提出的。目前被认为是最有前途的biclustering方法识别有意义的结构复杂、噪声数据。

作者:Patryk Orzechowski,阿图尔Pańszczyk

维护人员:Patryk Orzechowski < Patryk。在gmail.com orzechowski >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“runibic”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“runibic”)

HTML		runibic: UniBic R教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,报道,GeneExpression,微阵列,测序,软件
版本	1.21.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0),biclust,SummarizedExperiment
进口	Rcpp(> = 0.12.12),testthat、方法
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,GEOquery,affy,气道,QUBIC
SystemRequirements	GNU c++ 11日
增强了
URL	http://github.com/athril/runibic
BugReports	http://github.com/athril/runibic/issues
取决于我
进口我
建议我	mosbi
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	runibic_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	runibic_1.21.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/runibic
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ runibic
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/runibic/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/runibic/
包下载报告	下载数据