rsem

DOI:10.18129 / B9.bioc.rsemmed

这是发展rsem版本;稳定的发布版本,请参阅rsem。

一个接口语义MEDLINE数据库

Bioconductor版本:发展(3.18)

编程接口语义MEDLINE数据库。它提供函数搜索数据库概念和概念之间寻找路径。路径搜索也可以根据用户的具体要求,比如限制概念类型和概念之间的联系的类型。它还提供了总结和可视化这些路径的功能。

作者:莱斯利敏(aut (cre)

维护人员:莱斯利敏<莱斯利。敏在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“rsem”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rsem”)

HTML	R脚本	rsem用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,通路,软件,SystemsBiology
版本	1.11.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0), igraph
进口	方法、magrittr stringr dplyr
链接
建议	testthat knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmyint/rsemmed
BugReports	https://github.com/lmyint/rsemmed/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rsemmed_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	rsemmed_1.11.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rsemmed_1.11.0.tgz
macOS二进制(arm64)	rsemmed_1.11.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsemmed
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rsem
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rsemmed/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rsemmed/
包下载报告	下载数据