rpx

DOI:10.18129 / B9.bioc.rpx

这是发展rpx的版本;稳定版请参见rpx．

R到ProteomeXchange存储库的接口

Bioconductor版本:开发(3.17)

rpx包实现了提交给ProteomeXchange联盟的蛋白质组学数据的接口。

作者:Laurent Gatto

维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("rpx")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rpx”)

超文本标记语言	R脚本	一个到ProteomeXchange存储库的R接口
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件，ThirdPartyClient
版本	2.7.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(9年)
许可证	GPL-2
取决于	方法
进口	BiocFileCache，jsonlite，xml2，RCurl，旋度,跑龙套
链接
建议	Biostrings，BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lgatto/rpx
BugReports	https://github.com/lgatto/rpx/issues
全靠我
进口我
建议我	MsExperiment，MSnbase，PSMatch，RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rpx_2.7.0.tar.gz
Windows二进制	rpx_2.7.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	rpx_2.7.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	rpx_2.7.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rpx
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rpx
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rpx/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rpx/
软件包下载报告	下载数据