rprimer

DOI:10.18129 / B9.bioc.rprimer

这是发展rprimer版本;稳定的发布版本,请参阅rprimer。

设计简并从多个DNA寡核苷酸序列比对

Bioconductor版本:发展(3.18)

函数、工作流和闪亮的可视化申请保护和设计简并引物,序列探针,(RT)——(q / d) PCR分析从多个DNA序列比对。结果可以在数据帧格式和可视化为dashboard-like情节。有关更多信息,请参见包装饰图案。

作者:索菲亚佩尔森(aut (cre)

维护人员:索菲亚佩尔森< sofiapersson27 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“rprimer”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rprimer”)

HTML	R脚本	使用说明的
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,报道,MultipleSequenceAlignment,SequenceMatching,软件,ddPCR,qPCR
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	Biostringsbslib, DT, ggplot2,IRangesreshape2 mathjaxr方法,东拼西凑,S4Vectors闪亮的、shinycssloaders shinyFeedback
链接
建议	BiocStyle整,kableExtra covr knitr rmarkdown,器,testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sofpn/rprimer
BugReports	https://github.com/sofpn/rprimer/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rprimer_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	rprimer_1.5.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rprimer_1.5.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rprimer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rprimer
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rprimer/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rprimer/
包下载报告	下载数据