这是发展rnaEditr版本;稳定版请参见rnaEditr.
Bioconductor版本:开发(3.17)
RNAeditr分析特定位点的RNA编辑事件,以及超编辑区域。编辑频率可以根据二进制、连续或生存结果进行测试。多协变量以及相互作用效应也可以纳入统计模型。
作者:张兰宇[aut, cre], Gabriel Odom [aut], Tiago Silva [aut], Lissette Gomez [aut], Lily Wang [aut]
维护者:Lanyu Zhang
引文(从R内,输入引用(“rnaEditr”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("rnaEditr")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rnaEditr”)
超文本标记语言 | R脚本 | rnaEditr简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DimensionReduction,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneTarget,RNASeq,回归,软件,生存 |
版本 | 1.9.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomeInfoDb,bumphunter,S4Vectors统计数据,生存,logistf,plyr,corrplot |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr |
BugReports | https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | rnaEditr_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | rnaEditr_1.9.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | rnaEditr_1.9.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | rnaEditr_1.9.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaEditr |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rnaEditr |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/rnaEditr/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaEditr/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |