rnaEditr

DOI:10.18129 / B9.bioc.rnaEditr

这是发展rnaEditr版本;稳定版请参见rnaEditr

RNA编辑位点和超编辑区域的统计分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

RNAeditr分析特定位点的RNA编辑事件,以及超编辑区域。编辑频率可以根据二进制、连续或生存结果进行测试。多协变量以及相互作用效应也可以纳入统计模型。

作者:张兰宇[aut, cre], Gabriel Odom [aut], Tiago Silva [aut], Lissette Gomez [aut], Lily Wang [aut]

维护者:Lanyu Zhang

引文(从R内,输入引用(“rnaEditr”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("rnaEditr")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rnaEditr”)

超文本标记语言 R脚本 rnaEditr简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DimensionReduction表观遗传学FeatureExtractionGeneTargetRNASeq回归软件生存
版本 1.9.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 4.0)
进口 GenomicRangesIRangesBiocGenericsGenomeInfoDbbumphunterS4Vectors统计数据,生存logistfplyrcorrplot
链接
建议 knitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr
BugReports https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rnaEditr_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 rnaEditr_1.9.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) rnaEditr_1.9.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) rnaEditr_1.9.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaEditr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rnaEditr
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rnaEditr/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaEditr/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网