rnaEditr

DOI:10.18129 / B9.bioc.rnaEditr

这是发展rnaEditr版本;稳定版请参见rnaEditr．

RNA编辑位点和超编辑区域的统计分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

RNAeditr分析特定位点的RNA编辑事件，以及超编辑区域。编辑频率可以根据二进制、连续或生存结果进行测试。多协变量以及相互作用效应也可以纳入统计模型。

作者:张兰宇[aut, cre]， Gabriel Odom [aut]， Tiago Silva [aut]， Lissette Gomez [aut]， Lily Wang [aut]

维护者:Lanyu Zhang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("rnaEditr")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rnaEditr”)

超文本标记语言	R脚本	rnaEditr简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，表观遗传学，FeatureExtraction，GeneTarget，RNASeq，回归，软件，生存
版本	1.9.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	GenomicRanges，IRanges，BiocGenerics，GenomeInfoDb，bumphunter，S4Vectors统计数据,生存，logistf，plyr，corrplot
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr
BugReports	https://github.com/TransBioInfoLab/rnaEditr/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rnaEditr_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	rnaEditr_1.9.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	rnaEditr_1.9.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	rnaEditr_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaEditr
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rnaEditr
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rnaEditr/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rnaEditr/
软件包下载报告	下载数据