rgoslin

DOI:10.18129 / B9.bioc.rgoslin

这是发展rgoslin的版本;稳定版请参见rgoslin

脂类简写名称解析与规范化

Bioconductor版本:开发(3.17)

简明脂类命名法语法的R实现解析脂类名称的不同速记符号方言。它将它们规范化为标准名称。它进一步为每个成功解析的脂类名称提供了计算的单同位素质量和总和公式,并补充了脂类地图类别和类信息。此外,在适用的情况下,返回关于头部基团、脂肪酰基和官能团的结构层次和进一步的结构细节。

作者:Nils Hoffmann [aut, cre],多米尼克·科琴斯基[au]

维护人员:Nils Hoffmann < Nils。霍夫曼在cebitec.uni-bielefeld.de>

引文(从R内,输入引用(“rgoslin”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("rgoslin")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rgoslin”)

超文本标记语言 R脚本 用R Goslin对脂质命名法进行解析和归一化
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews LipidomicsMassSpectrometry代谢组学归一化预处理软件
版本 1.3.0
在Bioconductor BioC 3.15 (R-4.2)(1年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于
进口 Rcpp(> = 1.0.3),dplyr
链接 Rcpp
建议 testthat(> =魅惑,BiocStyleknitrrmarkdownkableExtraBiocManagerstringrggplot2宠物猫lipidr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lifs-tools/rgoslin
BugReports https://github.com/lifs-tools/rgoslin/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rgoslin_1.3.0.tar.gz
Windows二进制 rgoslin_1.3.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) rgoslin_1.3.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) rgoslin_1.3.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgoslin
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rgoslin
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rgoslin/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rgoslin/
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