restfulSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.restfulSE

这是发展restfulSE版本;稳定的发布版本,请参阅restfulSE。

访问矩阵像HDF5服务器内容或BigQuery内容通过SummarizedExperiment接口

Bioconductor版本:发展(3.14)

这个包提供了函数和类与远程数据存储接口通过SummarizedExperiment-like对象进行操作。

作者:文森特•凯里< stvjc channing.harvard.edu >什维塔Gopaulakrishnan < shwetagopaul92 gmail.com >

维护人员:什维塔Gopaulakrishnan < shwetagopaul92 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“restfulSE”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	报道,基础设施,测序,SingleCell,软件,转录组
版本	1.15.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),SummarizedExperiment,DelayedArray
进口	跑龙套、属性、方法S4Vectors,Biobase,reshape2,AnnotationDbi,DBIGO.db,rhdf5client,dplyr(> =是0.7.1),magrittr,bigrquery,ExperimentHub,AnnotationHub,rlang
链接
建议	knitr,testthat,Rtsne,org.Mm.eg。db, org.Hs.eg.dbBiocStyle,restfulSEData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	tenXplore
进口我
建议我	BiocOncoTK,BiocSklearn
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/restfulSE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ restfulSE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/restfulSE/
包下载报告	下载数据