receptLoss

DOI:10.18129 / B9.bioc.receptLoss

这是发展receitloss版本;稳定版请参见receptLoss．

肿瘤亚群中表达缺失基因的无监督鉴定

Bioconductor版本:开发(3.17)

受体损失鉴定基因的表达丢失在亚组肿瘤相对正常组织。它特别适合于正常组织样本数量较少的情况，因为正常组织样本中基因表达的分布近似于高斯分布。最初设计用于识别核激素受体表达缺失，但也可以广泛应用于转录组。

作者:丹尼尔·皮克，约翰·格雷利，杰西卡·马

维护者:Daniel Pique < Daniel。Pique在med.einstein.yu.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" receitloss ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“receptLoss”)

超文本标记语言	R脚本	receptLoss
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，软件，StatisticalMethod
版本	1.11.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(3年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	dplyr，ggplot2，magrittr，tidyr，SummarizedExperiment
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat(> =魅惑,在这里
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	receptLoss_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	receptLoss_1.11.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	receptLoss_1.11.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	receptLoss_1.11.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/receptLoss
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ receitloss
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/receptLoss/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/receptLoss/
软件包下载报告	下载数据