rwikipathways

doi:10.18129/b9.bioc.rwikipathways

这是发展Rwikipathways的版本;对于稳定版本,请参阅rwikipathways

rwikipathways -R wikipathways API的客户库库

生物导体版本:开发(3.16)

使用此软件包与Wikipathways API接口。它以多种数据和图像格式提供对Wikipathways内容的程序化访问,包括正式的每月发布文件和方便的GMT读/写功能。

作者:Egon Willighagen [AUT,CRE],Alex Pico [aut]

维护者:egon willighagen

引用(从r内,输入引用(“ rwikipathways”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ rwikipathways”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Rwikipathways”)

html R脚本 1.概述
html R脚本 2. rwikipathways和桥接桥
html R脚本 3. rwikipathways and rcy3
html R脚本 4.途径分析
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 GraphandNetwork,,,,代谢组学,,,,网络,,,,软件,,,,第三派对人,,,,可视化
版本 1.17.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看
进口 httr,utils,XML,,,,rjson,,,,Data.Table,,,,花花公子,,,,rcurl
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/wikipathways/rwikipathways
BugReports https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues
取决于我
进口我 Famat,,,,多方,,,,诺斯,,,,Timirgen
建议我 Tronco
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rwikipathways_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 rwikipathways_1.17.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rwikipathways_1.17.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rwikipathways
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rwikipathways
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rwikipathways/
软件包下载报告 下载统计

文档»

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支持»

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网