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- Bioconductor 3.17
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- rBiopaxParser(开发版)
rBiopaxParser
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DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser
这是发展rBiopaxParser版本;稳定的发布版本,请参阅rBiopaxParser。
解析BioPax文件和在R代表他们
Bioconductor版本:发展(3.17)
解析BioPAX文件和代表在R,此刻BioPAX 2级和3级支持。
作者:弗兰克·克莱默
维护人员:弗兰克·克雷默< frank.kramer在informatik.uni-augsburg.de >
从内部引用(R,回车引用(“rBiopaxParser”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“rBiopaxParser”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“rBiopaxParser”)
| R脚本 | rBiopaxParser装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataRepresentation,软件 |
| 版本 | 2.39.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(10年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 4.0),data.table |
| 进口 | XML |
| 链接 | |
| 建议 | Rgraphviz,RCurl,图,RUnit,BiocGenerics,RBGL,igraph |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser |
| 取决于我 | |
| 进口我 | pwOmics |
| 建议我 | AnnotationHub,NetPathMiner |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | rBiopaxParser_2.39.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rBiopaxParser_2.39.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | rBiopaxParser_2.39.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | rBiopaxParser_2.39.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rBiopaxParser |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/rBiopaxParser/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rBiopaxParser/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
