QVALUE

doi:10.18129/b9.bioc.qvalue

这是发展Qvalue的版本;对于稳定版本,请参阅QVALUE

错误发现率控制的Q值估计

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包列出了由许多假设的同时测试产生的p值列表,并估算了其Q值和局部FDR值。当该特定测试称为显着时,测试的Q值测量产生的假阳性(称为假发现率)的比例。鉴于测试的p值,局部FDR测量了零假设的后验概率。各种图会自动生成,从而使一个明智的意义截止。最近已经显示了该软件估计的Q值的保守准确性。该软件可以应用于基因组学,大脑成像,天体物理学和数据挖掘方面的问题。

作者:John D. Storey [Aut,Cre],Andrew J. Bass [AUT],Alan Dabney [AUT],David Robinson [AUT],Gregory Warnes [CTB]

维护者:John D. Storey ,Andrew J. Bass 的Ajbass>

引用(从r内,输入引用(“ QVALUE”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ qvalue”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ Qvalue”)

PDF R脚本 QVALUE软件包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 多蛋白酶,,,,软件
版本 2.29.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年)
执照 LGPL
要看 R(> = 2.10)
进口 花键,GGPLOT2, 网格,RESHAPE2
链接
建议 尼特
系统要求
增强
URL http://github.com/jdstorey/qvalue
取决于我 Anota,,,,嵌合体脑,,,,degseq,,,,drugvsdisease,,,,R3CSEQ,,,,Webbioc
进口我 阿纳金,,,,Anota,,,,anota2seq,,,,冠军,,,,clusterProfiler,,,,德芬德,,,,剂量,,,,边缘,,,,Epihet,,,,Erccdashboard,,,,EventPointer,,,,Findit2,,,,鱼池,,,,ihwpaper,,,,intad,,,,metaseqr2,,,,甲基库,,,,妈妈,,,,msmstests,,,,mwastools,,,,NetResponse,,,,NORMR,,,,关键,,,,过去的,,,,Ribodipa,,,,rnasense,,,,rnits,,,,罗尔德,,,,SDAMS,,,,景点,,,,SignaturesEarch,,,,subseq,,,,突触,,,,扳机,,,,Webbioc
建议我 生物室,,,,lbe,,,,Maanova,,,,preda,,,,rnainteractmapk,,,,rnbeads,,,,rnbeads,,,,总结,,,,SWFDR
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 qvalue_2.29.0.tar.gz
Windows二进制 qvalue_2.29.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) qvalue_2.29.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qvalue
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/qvalue
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/qvalue/
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