- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- quantro(开发版)
quantro
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DOI:10.18129 / B9.bioc.quantro
这是发展quantro版本;稳定的发布版本,请参阅quantro。
测试时使用分位数正常化
Bioconductor版本:发展(3.17)
一个数据驱动测试的假设分位数正常化使用对象继承eset等原始数据(例如ExpressionSet, MethylSet)。组级别每个样本的信息(如肿瘤/正常状态)也必须提供,因为测试评估如果有全球用户定义的组间的分布差异。
作者:斯蒂芬妮·希克斯(aut (cre)
拉斐尔•伊(aut)
维护人员:斯蒂芬妮·希克斯< shicks19 jhu.edu >
从内部引用(R,回车引用(“quantro”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“quantro”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“quantro”)
| HTML | R脚本 | quantro用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,测序,软件 |
| 版本 | 1.33.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | Biobase,minfi,doParallel,foreach,迭代器,ggplot2、方法、RColorBrewer |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown,knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 纱 |
| 建议我 | qsmooth |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | quantro_1.33.1.tar.gz |
| Windows二进制 | quantro_1.33.1.zip |
| macOS二进制(x86_64) | quantro_1.33.1.tgz |
| macOS二进制(arm64) | quantro_1.33.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quantro |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ quantro |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/quantro/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/quantro/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
