- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- qrqc(开发版)
qrqc
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DOI:10.18129 / B9.bioc.qrqc
这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。
这是发展qrqc版本;稳定的发布版本,请参阅qrqc。
快速阅读质量控制
Bioconductor版本:发展(3.18)
快速扫描读取并收集统计基础和质量频率,读取长度,k-mers位置,和频繁的序列。生产统计图形输出用于质量控制管道,和一个可选的HTML质量报告。S4 SequenceSummary对象允许特定的测试和功能写在收集的数据。
作者:文斯水牛
维修工:文斯水牛< vsbuffalo ucdavis.edu >
从内部引用(R,回车引用(“qrqc”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“qrqc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DataImport,预处理,质量控制,测序,软件,可视化 |
| 版本 | 1.55.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(12年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | ggplot2重塑,Biostrings,biovizBase、酿造、xtable testthat |
| 进口 | ggplot2重塑,Biostrings,biovizBase、图形、方法、plyr统计数据 |
| 链接 | Rhtslib(> = 1.15.3) |
| 建议 | |
| SystemRequirements | GNU使 |
| 增强了 | |
| URL | http://github.com/vsbuffalo/qrqc |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qrqc |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qrqc |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qrqc/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
