psygenet2r

DOI:10.18129 / B9.bioc.psygenet2r

这是发展psygenet2r版本;稳定的发布版本,请参阅psygenet2r。

psygenet2r - R包查询PsyGeNET和执行精神障碍共病研究

Bioconductor版本:发展(3.18)

包PsyGeNET从数据库检索数据(www.psygenet.org)和执行疾病研究与PsyGeNET和用户的数据。

作者:阿尔巴Gutierrez-Sacristan (aut (cre),卡莱斯Hernandez-Ferrer (aut) Jaun r·冈萨雷斯(aut),劳拉。弗隆(aut)

维护人员:阿尔巴Gutierrez-Sacristan < a.gutierrez。在gmail.com上教堂司事>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“psygenet2r”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“psygenet2r”)

HTML	R脚本	psygenet2r: R包查询PsyGeNET和执行精神障碍共病研究
HTML	R脚本	psygenet2r:案例研究对GWAS躁郁症
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,DataImport,DataRepresentation,遗传学,基础设施,软件
版本	1.33.5
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(7年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4)
进口	stringr、RCurl igraph、ggplot2 reshape2,网格,平行,biomaRt,BgeeDB,topGO,Biobase,标签,GO.db
链接
建议	testthat、knitr rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	psygenet2r_1.33.5.tar.gz
Windows二进制	psygenet2r_1.33.5.zip
macOS二进制(x86_64)	psygenet2r_1.33.5.tgz
macOS二进制(arm64)	psygenet2r_1.33.5.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/psygenet2r
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ psygenet2r
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/psygenet2r/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/psygenet2r/
包下载报告	下载数据