后代

DOI：10.18129 / b9.bioc.progeny.

这是发展版本的后代;对于稳定的版本版本，请参阅后代。

来自基因表达的活性推断的途径敏感基因

Bioconductor版本：开发（3.13）

该包裹提供了使用后代从基因表达推断出途径活性的功能。它包含我们在出版物中推断的线性模型“扰动 - 反应基因显示癌症基因表达中的信令占地面积”。

作者：Michael Schubert [Aut]，Alberto Valdeolivas [CRE，CTB]，Christian H. Holland [CTB]，Igor Bulanov [CTB]，Auréliendugourd [CTB]

维护者：Alberto Valdeolivas

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！quancamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）＃下面初始化buoc devel biocmanager :: install的使用（版本='devel'）biocmanager ::安装（“后代”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“后代”）

HTML.	r script.	在单细胞RNA-SEQ数据上应用后代
HTML.	r script.	后代途径签名：应用于批量转录组物
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	functionalpritiction.那基因表达那Generegulation.那软件那系统生物学
版本	1.13.0
在生物导体中以来	BIOC 3.6（R-3.4）（3.5岁）
执照	Apache许可证（== 2.0）|文件执照
依靠	r（> = 3.6.0）
进口	BioBase.，统计，dplyr.那Tidyr.那ggplot2.那GGRepel.那格拉底
链接到
建议	呼吸道那生物雕那biocfilecache.那扫帚那Seurat.那SinglecellexPeriment.那deseq2.那生物焦那kn那读书那readxl.那Pheatmap.那娇媚那testthat.（> = 2.1.0）
系统要求
加强
URL.	https://github.com/saezlab/progeny.
Bugreports.	https://github.com/saezlab/progeny/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	progeny_1.13.0.tar.gz.
Windows二进制文件	progeny_1.13.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	progeny_1.13.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/progeny.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包裹/后代
包短网址	https://biocumon.org/packages/progeny/
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