- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- procoil(开发版)
procoil
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DOI:10.18129 / B9.bioc.procoil
这是发展procoil版本;稳定的发布版本,请参阅procoil。
预测的卷曲螺旋蛋白质寡聚化
Bioconductor版本:发展(3.18)
包允许预测是否卷曲螺旋序列(氨基酸序列加七个寄存器)更有可能形成二聚体或更容易形成三聚物。另外预测本身,预测剖面计算可以确定个人的长处残留表明两类。预测配置文件也可以被可视化为曲线或热图。
作者:乌尔里希Bodenhofer
维护人员:乌尔里希Bodenhofer < Bodenhofer在bioinf.jku.at >
从内部引用(R,回车引用(“procoil”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“procoil”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“procoil”)
| R脚本 | PrOCoil——Web服务和R包预测卷曲螺旋的齐聚反应的蛋白质 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,蛋白质组学,软件,SupportVectorMachine |
| 版本 | 2.29.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(12年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.3.0),烤肉串 |
| 进口 | 方法、数据、图形、S4Vectors,Biostrings,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bioinf.jku.at/software/procoil/https://github.com/UBod/procoil |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | procoil_2.29.0.tar.gz |
| Windows二进制 | procoil_2.29.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | procoil_2.29.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/procoil |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ procoil |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/procoil/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/procoil/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
