proDA

DOI:10.18129 / B9.bioc.proDA

这是发展proDA版本;稳定版请参见proDA

无标签质谱数据的差异丰度分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

解释无标签质谱数据中缺失的值。该包实现了一个概率退出模型,确保来自观测值和缺失值的信息正确组合。它增加了经验贝叶斯先验,以增加检测差异丰度蛋白质的能力。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze [aut, cre]——西蒙·安德斯

维护者:Constantin Ahlmann-Eltze

引文(从R内,输入引用(“proDA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("proDA")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“proDA”)

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细节

biocViews 贝叶斯DifferentialExpressionMassSpectrometry归一化蛋白质组学质量控制回归软件
版本 1.11.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 统计,效用,方法,BiocGenericsSummarizedExperimentS4VectorsextraDistr
链接
建议 testthat(> =魅惑,MSnbasedplyrstringrreadrtidyr宠物猫limmanumDerivpheatmapknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/const-ae/proDA
BugReports https://github.com/const-ae/proDA/issues
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进口我 MatrixQCvis
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 proDA_1.11.0.tar.gz
Windows二进制 proDA_1.11.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) proDA_1.11.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proDA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/proDA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/proDA/
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