概率

doi：10.18129/b9.bioc.probatch

这是发展Probatch的版本；对于稳定版本，请参阅概率。

诊断和纠正蛋白质组学中批处理效果的工具

生物导体版本：开发（3.16）

这些工具促进了高通量实验中的批处理效应分析和校正。它主要用于质谱法蛋白质组学（DIA/SWATH），但也可以适用于大多数具有较小适应性的OMIC数据。该软件包包含诊断（蛋白质组/基因组和特征级别），校正（归一化和批处理效果校正）和质量控制的功能。还包括基于非线性拟合的方法来处理复杂的质谱特异性信号漂移。

作者：jelena cuklina ，Chloe H. Lee

维护者：gmail.com上的Chloe H. Lee

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ probatch”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ probatch”）

PDF	R脚本	Probatch软件包概述
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	批处理效应，，，，质谱，，，，正常化，，，，预处理，，，，蛋白质组学，，，，QualityControl，，，，软件
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3.5岁）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.6）
进口	生物酶，，，，Corrplot，，，，dplyr，，，，Data.Table，，，，Ggfortify，，，，GGPLOT2，grdevices，懒惰，，，，橄榄酸，，，，马格里特，，，，pheatmap，，，，预处理，，，，purrr，，，，PVCA，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，，，，rlang，，，，秤，统计SVA，，，，花花公子，，，，蒂布尔，工具，utils，维里迪斯，，，，韦桑森，，，，WGCNA
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，DevTools，，，，ggpubr，，，，gtable，，，，栅格，，，，roxygen2，，，，测试（> = 2.1.0），拼写
系统要求
增强
URL	https://github.com/symbioticme/probatch
BugReports	https://github.com/symbioticme/probatch/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	probatch_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	probatch_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	probatch_1.13.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/probatch
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/概率
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/probatch/
软件包下载报告	下载统计