probamr

doi:10.18129/b9.bioc.probamr

这是发展probamr的版本;对于稳定版本,请参阅probamr

在shot弹枪蛋白质组学数据中生成SAM文件

生物导体版本:开发(3.16)

将PSM映射回基因组。该软件包从shot弹枪蛋白质组学数据中构建SAM文件该软件包还提供了从GTF文件准备注释的功能。

作者:王王

维护者:vanderbilt.edu> xiaojing wang

引用(从r内,输入引用(“ probamr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ probamr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ probamr”)

PDF R脚本 简介Probamr
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 免疫学,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.31.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(8年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.0.1),iranges,,,,AnnotationDbi
进口 基因组机,,,,生物弦,,,,GenomicFeatures,,,,rtracklayer
链接
建议 运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 probamr_1.31.0.tar.gz
Windows二进制 probamr_1.31.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) probamr_1.31.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/probamr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/probamr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/probamr/
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