婴儿车
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doi：10.18129/b9.bioc.pram
这是发展婴儿车的版本；对于稳定版本，请参阅婴儿车。
汇总用于组装成绩单模型的RNA-Seq数据集
生物导体版本：开发（3.16）
公开可用的RNA-seq数据通常用于回顾性分析，以阐明新的生物学。大量RNA-seq数据集的新成绩单发现已成为这样的分析之一。为了从RNA-Seq数据集的大量集合中提高成绩单发现的功能，我们开发了一个名为Pooling RNA-Seq和组装模型（PRAM）的新的R软件包，该软件包从合并的RNA-Seq数据集中构建了基因间区域的转录本模型。该软件包包括用于定义基因间区域，提取和汇总相关的RNA-seq比对，预测，选择和评估转录本模型的功能。
作者：Peng Liu [AUT，CRE]，Colin N. Dewey [AUT]，SündüzKeleş[aut]
维护者：peng liu
引用（从r内，输入引用（“婴儿车”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ PRAM”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ PRAM”）
| R脚本 | 汇总RNA-seq和组装模型 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 生物问题，，，，遗传，，，，基因数，，，，rnaseq，，，，研究菲尔德，，，，测序，，，，软件，，，，技术，，，，转录组学 |
| 版本 | 1.13.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | 方法，生物比较，工具，utils，Data.Table（> = 1.11.8），基因组签名（> = 1.16.0），rtracklayer（> = 1.40.6），生物基因（> = 0.26.0），GenomeInfodB（> = 1.16.0），基因组机（> = 1.32.0），iranges（> = 2.14.12），rsamtools（> = 1.32.3），S4VECTORS（> = 0.18.3） |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/pliu55/pram |
| BugReports | https://github.com/pliu55/pram/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pram_1.13.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pram_1.13.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pram |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/婴儿车 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pram/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
