这是发展pogo的版本;稳定的发布版本,请参阅pogo。
Bioconductor版本:发展(3.17)
提供简单的工具查询bhklab PharmacoDB、建模API输出,并整合细胞和复合本体。
作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >
维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(pogo)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(pogo)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (pogo)
HTML | R脚本 | pogo——简单的接口bhklab PharmacoDB强调本体 |
参考手册 |
biocViews | ImmunoOncology,药物基因组学,PooledScreens,软件 |
版本 | 1.19.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.5.0),rjson(> = 0.2.15),httr(> = 1.3.1) |
进口 | 方法,S4Vectors跑龙套,闪亮的,ontoProc,ggplot2、图形 |
链接 | |
建议 | knitr,DT,ontologyPlot,testthat,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BiocOncoTK |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | pogos_1.19.0.tar.gz |
Windows二进制 | pogos_1.19.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | pogos_1.19.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | pogos_1.19.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pogos |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pogo |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/pogos/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pogos/ |
包下载报告 | 下载数据 |