plyranges

doi:10.18129/b9.bioc.pherranges

这是发展plyranges的版本;对于稳定版本,请参阅plyranges

操纵基因组机械的流利界面

生物导体版本:开发(3.16)

与常见的生物导体类范围和基因组晶体相互作用的DPLYR样界面。通过提供一种语法和一致的方式来操纵这些课程,他们为新的生物导体使用者提供了访问权限。

作者:Stuart Lee [AUT,CRE],迈克尔·劳伦斯[AUT,CTB],Dianne Cook [AUT,CTB],Spencer Nystrom [CTB]

维护者:stuart lee

引用(从r内,输入引用(“ plyranges”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ plyranges”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ plyranges”)

html R脚本 介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件,,,,工作流程
版本 1.17.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5),生物基因,,,,iranges(> = 2.12.0),基因组机(> = 1.28.4)
进口 方法,dplyr,,,,rlang(> = 0.2.0),马格里特,,,,tidyselect(> = 1.0.0),rtracklayer,,,,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS(> = 0.23.10),UTILS
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 2.1.0),Helloranges,,,,Hellorangesdata,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,pasillabamsubset,,,,COVR,,,,GGPLOT2
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/sa-lee/plyranges
取决于我
进口我 Bobafit,,,,Busparse,,,,cfdnapro,,,,达斯珀,,,,Epicompare,,,,氟化物学,,,,inpas,,,,甲基接受,,,,Multicrispr,,,,附近,,,,nullranges,,,,Plotgardener
建议我 伸出,,,,模因,,,,Svanumt,,,,Svaretro
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 plyranges_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 plyranges_1.17.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) plyranges_1.17.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/plyranges
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/
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