这是发展plyranges的版本;对于稳定版本,请参阅plyranges。
生物导体版本:开发(3.16)
与常见的生物导体类范围和基因组晶体相互作用的DPLYR样界面。通过提供一种语法和一致的方式来操纵这些课程,他们为新的生物导体使用者提供了访问权限。
作者:Stuart Lee [AUT,CRE],迈克尔·劳伦斯[AUT,CTB],Dianne Cook [AUT,CTB],Spencer Nystrom [CTB]
维护者:stuart lee
引用(从r内,输入引用(“ plyranges”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ plyranges”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ plyranges”)
html | R脚本 | 介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件,,,,工作流程 |
版本 | 1.17.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(4。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.5),生物基因,,,,iranges(> = 2.12.0),基因组机(> = 1.28.4) |
进口 | 方法,dplyr,,,,rlang(> = 0.2.0),马格里特,,,,tidyselect(> = 1.0.0),rtracklayer,,,,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS(> = 0.23.10),UTILS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 2.1.0),Helloranges,,,,Hellorangesdata,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,pasillabamsubset,,,,COVR,,,,GGPLOT2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/sa-lee/plyranges |
取决于我 | |
进口我 | Bobafit,,,,Busparse,,,,cfdnapro,,,,达斯珀,,,,Epicompare,,,,氟化物学,,,,inpas,,,,甲基接受,,,,Multicrispr,,,,附近,,,,nullranges,,,,Plotgardener |
建议我 | 伸出,,,,模因,,,,Svanumt,,,,Svaretro |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | plyranges_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | plyranges_1.17.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | plyranges_1.17.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/plyranges |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/ |
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