plotGrouper

DOI:10.18129 / B9.bioc.plotGrouper

这是发展plotGrouper版本;稳定版请参见plotGrouper．

闪亮的应用程序GUI包装的ggplot内置统计分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

一个闪亮的基于应用程序的GUI包装的ggplot内置统计分析。从文件中导入数据，并使用下拉菜单和复选框来指定绘图变量、图形类型和图形外观。一旦创建，绘图可以独立保存，也可以存储在可以保存为pdf格式的报告中。如果向文件中添加了新数据，则可以刷新报告以包含新数据。可以选择统计测试并将其添加到图中。流式细胞术数据的分析特别与plotGrouper集成。计数数据可以转换为返回样品中细胞的绝对数量(此功能需要包括每个样品的珠数和任何稀释的信息)。

作者:John D. Gagnon [aut, cre]

维护者:John D. Gagnon < John . Gagnon。42在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("plotGrouper")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“plotGrouper”)

超文本标记语言	R脚本	plotGrouper
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，FlowCytometry，GUI，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，MultipleComparison，软件，StatisticalMethod
版本	1.17.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)
进口	ggplot2(> = 3.0.0),dplyr(> = 0.7.6),tidyr(> = 0.2.0),宠物猫(> = 1.4.2),stringr(> = 1.3.1),readr(> = 1.1.1),readxl(> = 1.1.0版),尺度(>= 1.0.0)，统计，网格，gridExtra(> = 2.3),蛋(> = 0.4.0),gtable(> = 0.2.0),ggpubr(> = 0.1.8),闪亮的(> = 1.1.0版),shinythemes(> = 1.1.1),colourpicker(> = 1.0),magrittr(> = 1.5),Hmisc(> =以下4.4.1),rlang(> = 0.2.2)
链接
建议	knitr，htmltools，BiocStyle，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://jdgagnon.github.io/plotGrouper/
BugReports	https://github.com/jdgagnon/plotGrouper/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	plotGrouper_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	plotGrouper_1.17.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	plotGrouper_1.17.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	plotGrouper_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plotGrouper
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/plotGrouper
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/plotGrouper/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plotGrouper/
软件包下载报告	下载数据