plgem

DOI:10.18129 / B9.bioc.plgem

这是发展plgem版本;稳定的发布版本,请参阅plgem。

检测差异表达基因芯片和蛋白质组学数据集的幂律全球误差模型(PLGEM)

Bioconductor版本:发展(3.14)

全球错误幂律模型(PLGEM)已被证明切实模型中存在variance-versus-mean依赖各种各样的全基因组数据集,包括芯片和蛋白质组学数据。PLGEM的使用已被证明能够改善差异表达基因或蛋白质的检测这些数据集。

作者:马狄亚< Mattia。裴里荣拉gmail.com >和诺曼·帕夫卡< normanpavelka gmail.com >

维修工:诺曼·帕夫卡< normanpavelka gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“plgem”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“plgem”)

PDF	R脚本	介绍PLGEM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,MassSpectrometry,微阵列,蛋白质组学,软件
版本	1.65.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 16年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10)
进口	跑龙套,Biobase(> = 2.5.5),质量、方法
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.genopolis.it
取决于我
进口我	检查
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	plgem_1.65.0.tar.gz
Windows二进制	plgem_1.65.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	plgem_1.65.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plgem
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ plgem
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plgem/
包下载报告	下载数据