地球

DOI:10.18129 / B9.bioc.planet

这是发展行星版本;稳定版请参见地球．

胎盘DNA甲基化分析工具

Bioconductor版本:开发(3.17)

这个包包含R函数来推断额外的生物变量，以补充胎盘数据的DNA甲基化分析。这包括从胎盘DNA甲基化阵列(450k/850k)数据推断种族/血统、胎龄和细胞组成。该软件包附带一个经过处理的胎盘数据集示例。

作者:Victor Yuan [aut, cre]， Wendy P. Robinson [ctb]

维护者:Victor Yuan < Victor。2wy在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("planet")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“行星”)

超文本标记语言	R脚本	地球
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialMethylation，表观遗传学，MethylationArray，微阵列，软件
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 4.0)
进口	方法,宠物猫，magrittr，dplyr
链接
建议	ggplot2，testthat，tidyr，尺度，minfi，EpiDISH，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://victor.rbind.io/planethttp://github.com/wvictor14/planet
BugReports	http://github.com/wvictor14/planet/issues
全靠我
进口我	methylclock
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	planet_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	planet_1.7.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	planet_1.7.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	planet_1.7.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/planet
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/planet
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/planet/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/planet/
软件包下载报告	下载数据