钢琴

DOI:10.18129 / B9.bioc.piano

这是发展钢琴的版本;稳定的发布版本,请参阅钢琴。

组学数据的综合分析平台

Bioconductor版本:发展(3.17)

钢琴执行基因集使用各种统计分析方法,从不同的基因水平统计和广泛的基因片段的集合。此外,钢琴包包含函数结合基因集的多个运行分析的结果。

作者:列夫Varemo Wigge <钢琴。在gmail.com rpkg >和Intawat Nookaew

维护人员:列夫Varemo Wigge <钢琴。在gmail.com rpkg >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“钢琴”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(钢琴)

PDF	R脚本	钢琴——组学数据的综合分析平台
HTML	R脚本	运行与钢琴基因片段的分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,通路,预处理,质量控制,软件,可视化
版本	2.15.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(10年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5)
进口	BiocGenerics,Biobase,gplots,igraph,关系,marray,fgsea,闪亮的,DT,htmlwidgets,shinyjs,shinydashboard,visNetwork,尺度grDevices图形,统计,跑龙套,方法
链接
建议	yeast2.db,rsbml,plotrix,limma,affy,钳子,affyPLM,gtools,biomaRt,降雪,AnnotationDbi,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.sysbio.se/piano
BugReports	https://github.com/varemo/piano/issues
取决于我
进口我	CoreGx,PDATK
建议我	BloodCancerMultiOmics2017,cosmosR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	piano_2.15.0.tar.gz
Windows二进制	piano_2.15.0.zip
macOS二进制(x86_64)	piano_2.15.0.tgz
macOS二进制(arm64)	piano_2.15.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/piano
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/钢琴
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/piano/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/piano/
包下载报告	下载数据