- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- phenopath(开发版)
phenopath
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DOI:10.18129 / B9.bioc.phenopath
这是发展phenopath版本;稳定的发布版本,请参阅phenopath。
基因组轨迹与异构遗传和环境背景
Bioconductor版本:发展(3.16)
PhenoPath推断基因轨迹(拟时间)的异构遗传和环境背景和测试之间的相互作用。
作者:基兰·坎贝尔
维修工:基兰·坎贝尔在gmail.com < kieranrcampbell >
从内部引用(R,回车引用(“phenopath”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“phenopath”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“phenopath”)
| HTML | R脚本 | 装饰图案的标题 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 贝叶斯,GeneExpression,ImmunoOncology,PrincipalComponent,RNASeq,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.21.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年) |
| 许可证 | Apache许可(= = 2.0) |
| 取决于 | |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.8),SummarizedExperiment、方法、统计数据dplyr,宠物猫,ggplot2,tidyr |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr,rmarkdown,forcats,testthat,BiocStyle,SingleCellExperiment |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 飞溅 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | phenopath_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | phenopath_1.21.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | phenopath_1.21.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenopath |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ phenopath |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phenopath/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
