这是发展phemd版本;稳定版请参见phemd.
Bioconductor版本:开发(3.17)
包,用于比较和生成多个单细胞样本的低维嵌入。
作者:William S Chen
维护者:William S Chen < will .yum。陈在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“phemd”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("phemd")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | 聚类,ComparativeGenomics,DataRepresentation,DimensionReduction,MultipleComparison,蛋白质组学,测序,SingleCell,软件,转录组,可视化 |
版本 | 1.15.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.5),单片眼镜,修拉 |
进口 | SingleCellExperiment,RColorBrewer,igraph,运输,pracma,集群,Rtsne,命运,RANN,ggplot2,maptree,pheatmap,scatterplot3d,VGAM,方法,grDevices,图形,统计,utils,cowplot,S4Vectors,BiocGenerics,SummarizedExperiment,Biobase,酷毙了,网状 |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phemd |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/phemd |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phemd/ |
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