phantasus

doi：10.18129/b9.bioc.phantasus

这是发展Phantasus的版本；对于稳定版本，请参阅phantasus。

视觉和互动基因表达分析

生物导体版本：开发（3.16）

Phantasus是用于视觉和交互式基因表达分析的网络应用。Phantasus基于Morpheus，该软件是一种用于热图可视化和分析的软件，该软件通过OpenCPU API与R环境集成在一起。除了基本的可视化和过滤方法外，还支持基于R的方法，例如K-均值聚类，主成分分析或Limma软件包的差异表达分析。

作者：Daria Zenkova [aut]，Vladislav Kamenev [aut]，Rita Sablina [CTB]，Maxim Kleverov [CTB]，Maxim Artyomov [aut]，Alexey Sergushichichev [aut，Cre，Cre，Cre，CRE]

维护者：gmail.com上的Alexey Sergushichev

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ phantasus”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Phantasus”）

html	R脚本	使用Phantasus应用
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	聚类，，，，datarepresentation，，，，差异性，，，，GUI，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，微阵列，，，，正常化，，，，委托人，，，，rnaseq，，，，软件，，，，转录组学，，，，可视化
版本	1.17.2
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.5）
进口	GGPLOT2，，，，原石，，，，生物酶，，，，地球，，，，车，，，，htmltools，，，，httpuv，，，，jsonlite，，，，林玛，，，，OPENCPU，，，，断言， 方法，httr，，，，RHDF5，utils，并行，Stringr，，，，fgsea（> = 1.9.4），svglite，，，，gtable，统计矩阵，，，，pheatmap，，，，秤，，，，CCAPP，网格，grdevices，AnnotationDbi，，，，deseq2，，，，Data.Table，，，，卷曲
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://genome.ifmo.ru/phantasushttps://artyomovlab.wustl.edu/phantasus
BugReports	https://github.com/ctlab/phantasus/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	phantasus_1.17.2.tar.gz
Windows二进制	phantasus_1.17.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	phantasus_1.17.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phantasus
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/phantasus
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/phantasus/
软件包下载报告	下载统计