pdInfoBuilder

DOI:10.18129 / B9.bioc.pdInfoBuilder

这是发展pdInfoBuilder的版本;稳定版请参见pdInfoBuilder．

平台设计信息包构建器

Bioconductor版本:开发(3.17)

构建平台设计信息包。这些由包含特征级数据的SQLite数据库组成，如x、y在芯片上的位置和featureSet ID。数据库还包含了feature set级别的注释数据。该包装产品用于低聚pkg。

作者:塞斯·福尔肯，文斯·凯里，马特·塞特斯，克里斯托夫·德·伯夫，贝尼尔顿·卡瓦略

维护者:Benilton Carvalho < Benilton at unicamp.br>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("pdInfoBuilder")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pdInfoBuilder”)

PDF		使用pdInfoBuilder构建注释包，用于oligo包
PDF	R脚本	PDInfo封装构建Affymetrix映射芯片
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，基础设施，软件
版本	1.63.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(16年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.2.0)，方法，Biobase(> = 2.27.3),RSQLite(> = 1.0.0),affxparser(> = 1.39.4),益生元(> = 1.31.5)
进口	Biostrings(> = 2.35.12),BiocGenerics(> = 0.13.11),DBI(> = 0.3.1),IRanges(> = 2.1.43),oligoClasses(> = 1.29.6),S4Vectors(> = 0.5.22)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	maqcExpression4plex
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	pdInfoBuilder_1.63.0.tar.gz
Windows二进制	pdInfoBuilder_1.63.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	pdInfoBuilder_1.63.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	pdInfoBuilder_1.63.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pdInfoBuilder
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pdInfoBuilder
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/pdInfoBuilder/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pdInfoBuilder/
软件包下载报告	下载数据