pcaMethods

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcaMethods

这是发展pcaMethods版本;稳定的发布版本,请参阅pcaMethods。

PCA方法的集合

Bioconductor版本:发展(3.16)

提供了贝叶斯PCA、概率主成分分析Nipals PCA、逆非线性PCA和传统的圣言PCA。基于集群的缺失值估计方法进行比较。BPCA、车牌提取和NipalsPCA可以用来对不完整的数据进行主成分分析以及准确的缺失值估计。一组印刷方法和策划的结果。所有PCA方法使用相同的数据结构(pcaRes)提供一个公共接口,主成分分析的结果。大的分子植物生理学研究所发起的,,德国歌。

作者:Wolfram Stacklies Henning Redestig,凯文莱特

维护人员:亨宁Redestig <亨宁。红色在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“pcaMethods”)

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文档

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browseVignettes (“pcaMethods”)

PDF	R脚本	数据与异常值
PDF	R脚本	介绍
PDF	R脚本	缺失值归责
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯,软件
版本	1.89.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(16岁)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	Biobase、方法
进口	BiocGenerics,Rcpp(> = 0.11.3),质量
链接	Rcpp
建议	matrixStats,晶格,ggplot2
SystemRequirements	Rcpp
增强了
URL	https://github.com/hredestig/pcamethods
BugReports	https://github.com/hredestig/pcamethods/issues
取决于我	DeconRNASeq
进口我	自治,consensusDE,DAPAR,命运,弗雷泽,梅,MatrixQCvis,MSnbase,MSPrep,MultiBaC,先驱者,PhosR,pmp,scde,SomaticSignatures
建议我	MsCoreUtils,mtbls2,QFeatures,qmtools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pcaMethods_1.89.0.tar.gz
Windows二进制	pcaMethods_1.89.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	pcaMethods_1.89.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaMethods
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pcaMethods
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pcaMethods/
包下载报告	下载数据