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DOI:10.18129 / B9.bioc.pageRank

这是发展pageRank的版本;稳定版请参见网页排名．

用于基因调控网络分析的时序和多重PageRank

Bioconductor版本:开发(3.16)

实现了由Rozenshtein和Gionis定义的时态PageRank分析。实现了Halu等人定义的多路PageRank。PageRank在基因调控网络分析中的应用。

作者:丁鸿旭[aut, cre, ctb, cph]

维护者:丁宏旭

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("pageRank")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pageRank”)

PDF	R脚本	introduction.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneTarget，网络，软件，StatisticalMethod
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 4.0)
进口	GenomicRanges，igraph，motifmatchr，统计，utils, grDevices，图形
链接
建议	bcellViper，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，JASPAR2018，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，org.Hs.eg.db，TFBSTools，GenomicFeatures，注释
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hd2326/pageRank
BugReports	https://github.com/hd2326/pageRank/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	pageRank_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	pageRank_1.7.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	pageRank_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pageRank
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pageRank
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pageRank/
软件包下载报告	下载数据