openCyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.openCyto

这是发展openCyto的版本;稳定版请参见openCyto．

用于流式细胞仪数据的分层门控管道

Bioconductor版本:开发(3.17)

该包的设计是为了方便自动门控方法以顺序方式模拟手动门控策略。

作者:Mike Jiang, John Ramey, Greg Finak, Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang < Mike at ozette.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("openCyto")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“openCyto”)

超文本标记语言	R脚本	openCyto包简介
超文本标记语言	R脚本	如何使用不同的自动门控功能
超文本标记语言	R脚本	如何写一个csv门控模板
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，预处理，软件
版本	2.11.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(9.5年)
许可证	agpl - 3.0
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	方法,Biobase，BiocGenerics，flowCore(> = 1.99.17),flowViz，ncdfFlow(> = 2.11.34),flowWorkspace(> = 3.99.1),flowClust(> = 3.11.4),RBGL，图，data.table，RColorBrewer
链接	cpp11，黑洞
建议	flowWorkspaceData，knitr，rmarkdown，减价，testthat， utils，工具，并行，ggcyto，CytoML，flowStats(> = 4.5.2),质量
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	CytoML
建议我	催化剂，flowClust，flowCore，flowStats，flowTime，flowWorkspace，ggcyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	openCyto_2.11.1.tar.gz
Windows二进制	openCyto_2.11.1.zip
macOS二进制文件(x86_64)	openCyto_2.11.1.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openCyto
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/openCyto/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/openCyto/
软件包下载报告	下载数据