Ontoproc

doi：10.18129/b9.bioc.ontoproc

这是发展Ontoproc的版本；对于稳定版本，请参阅Ontoproc。

解剖学，细胞系等本体的处理

生物导体版本：开发（3.16）

支持收集各种生物信息学本体论，特别是在Cran上使用了OntologyIndex软件包。我们提供有关细胞，细胞系，化合物和解剖结构术语的关键本体论的快照，以帮助分析基因组规模实验，尤其是细胞X化合物筛选。另一个目的是加强引人注目的用例开发，以使其富裕的界面成为新的本体论。

作者：Vince Carey

维护者：vj Carey

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ ontoproc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Ontoproc”）

html	R脚本	ONTOPROC：一些面向本体的用单细胞焦点用于生物导体
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	去，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.19.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5），Ontology Indexex
进口	生物酶，，，，S4VECTORS， 方法，AnnotationDbi，统计，utils，Biocfilecache，，，，闪亮的，，，，图形，，，，rgraphviz，，，，本体学图，，，，dplyr，，，，马格里特，，，，DT，，，，Igraph，，，，AnnotationHub
链接
建议	尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，测试，，，，生物使用，，，，Singlecellexperiment，，，，CellDex，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我	Singlerbook
进口我	pogos，，，，tenxplore
建议我	Bioconcotk
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ontoproc_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	ontoproc_1.19.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ontoproc_1.19.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoproc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/ontoproc
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/ontoproc/
软件包下载报告	下载统计