oneSENSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.oneSENSE

这是发展oneSENSE版本;稳定版请参见oneSENSE．

基于非线性随机嵌入(OneSENSE)的一维单点表达式

Bioconductor版本:开发(3.17)

一个图形用户界面，便于基于t分布随机邻居嵌入(t-SNE)算法的降维方法，用于大规模细胞术数据的分类分析。使用one - sense，测量的参数被分组到预定义的类别中，每个类别的单元格被投影到一个由一维组成的空间上。每个维度都是信息丰富的，并且可以通过使用与每个轴平行对齐的热图进行注释，从而允许在二维图上同时可视化两个类别。结果图的细胞占用允许直接评估类别之间的关系。

作者:杨程，Evan Newell, Yong Kee Tan

维护者:Yong Kee Tan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("oneSENSE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	DimensionReduction，FlowCytometry，GUI，ImmunoOncology，软件
版本	1.21.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(5.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (>= 3.4)，webshot，闪亮的，shinyFiles，scatterplot3d
进口	Rtsne，情节，gplots， grDevices，图形，统计，utils，方法，flowCore
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)	oneSENSE_1.21.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	oneSENSE_1.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oneSENSE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/oneSENSE
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/oneSENSE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oneSENSE/
软件包下载报告	下载数据