omicsPrint

DOI:10.18129 / B9.bioc.omicsPrint

这是发展omicsPrint版本;稳定版请参见omicsPrint．

交叉组遗传指纹

Bioconductor版本:开发(3.17)

omicsPrint提供了跨组遗传指纹的功能，例如，验证多种组学数据类型之间的样本关系，即基因组、转录组和表观遗传(DNA甲基化)。

作者:Maarten van Iterson [aut]， Davy Cats [cre]

维护者:Davy Cats

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("omicsPrint")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“omicsPrint”)

超文本标记语言	R脚本	omicsPrint:多个组学研究中数据链接错误的检测
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，表观遗传学，GeneticVariability，遗传学，ImmunoOncology，质量控制，软件，转录，转录组
版本	1.19.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5)，质量
进口	方法,matrixStats，图形，统计，SummarizedExperiment，MultiAssayExperiment，RaggedExperiment
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，GEOquery，VariantAnnotation，Rsamtools，BiocParallel，GenomicRangesFDb.InfiniumMethylation.hg19,snpStats
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	omicsPrint_1.19.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicsPrint
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/omicsPrint
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/omicsPrint/
软件包下载报告	下载数据