omicRexposome

DOI:10.18129 / B9.bioc.omicRexposome

这是发展omicRexposome版本;稳定的发布版本,请参阅omicRexposome。

Exposome和使数据协会和集成分析

Bioconductor版本:发展(3.16)

omicRexposome目前常用曝光和使数据之间的关联评价,利用MultiDataSet协调数据管理、rexposome exposome数据定义和limma协会测试。也执行数据集成混合exposome和使用多co-inherent使数据分析(omicade4)和multi-canonical相关分析(PMA)。

作者:Carles Hernandez-Ferrer (aut (cre),胡安·r·冈萨雷斯(aut)

维护人员:Xavier Escriba梦特娇< xavier.escriba isglobal.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“omicRexposome”)

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文档

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browseVignettes (“omicRexposome”)

HTML	R脚本	使数据Exposome数据集成
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,DifferentialMethylation,表观遗传学,GeneExpression,GeneRegulation,ImmunoOncology,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件,StatisticalMethod,转录组,可视化,WorkflowStep
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0),Biobase
进口	属性,跑龙套,grDevices、图形的方法,rexposome,limma,股东价值分析,ggplot2,ggrepel,PMA,omicade4,gridExtra,MultiDataSet,SmartSVA,isva平行,SummarizedExperiment,stringr
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,snpStats,brgedata
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	omicRexposome_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	omicRexposome_1.19.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	omicRexposome_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicRexposome
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ omicRexposome
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/omicRexposome/
包下载报告	下载数据