omicRexposome

DOI:10.18129 / B9.bioc.omicRexposome

这是发展omicRexposome版本;稳定的发布版本,请参阅omicRexposome

Exposome和使数据协会和集成分析

Bioconductor版本:发展(3.16)

omicRexposome目前常用曝光和使数据之间的关联评价,利用MultiDataSet协调数据管理、rexposome exposome数据定义和limma协会测试。也执行数据集成混合exposome和使用多co-inherent使数据分析(omicade4)和multi-canonical相关分析(PMA)。

作者:Carles Hernandez-Ferrer (aut (cre),胡安·r·冈萨雷斯(aut)

维护人员:Xavier Escriba梦特娇< xavier.escriba isglobal.org >

从内部引用(R,回车引用(“omicRexposome”)):

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“omicRexposome”)

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文档

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HTML R脚本 使数据Exposome数据集成
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews DifferentialExpression,DifferentialMethylation,表观遗传学,GeneExpression,GeneRegulation,ImmunoOncology,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件,StatisticalMethod,转录组,可视化,WorkflowStep
版本 1.19.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 3.5.0),Biobase
进口 属性,跑龙套,grDevices、图形的方法,rexposome,limma,股东价值分析,ggplot2,ggrepel,PMA,omicade4,gridExtra,MultiDataSet,SmartSVA,isva平行,SummarizedExperiment,stringr
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,snpStats,brgedata
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

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源包 omicRexposome_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 omicRexposome_1.19.0.zip
macOS 10.13(高山脉) omicRexposome_1.19.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicRexposome
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ omicRexposome
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/omicRexposome/
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