诊断

DOI:10.18129 / B9.bioc.nucleR

这是发展版本的诊断;稳定的发布版本请参见诊断。

R

生物导体版本:开发(3.13)

Tiling阵列和NGS实验的核小体定位。

作者:Oscar Flores, Ricard Illa

维护者:Alba Sala < Alba。萨拉在irbbarcelona.org >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("nucleR")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“诊断”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,报道,DataImport,遗传学,微阵列,NucleosomePositioning,质量控制,测序,软件
版本	2.23.2
Bioconductor自	BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年)
许可证	LGPL (> = 3)
取决于	方法
进口	Biobase,BiocGenerics,Biostrings,GenomeInfoDb,GenomicRanges,IRanges,Rsamtools,S4Vectors,ShortRead,dplyr,ggplot2,magrittr， parallel, stats, utils, grDevices
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	nucleR_2.23.2.tar.gz
Windows二进制	nucleR_2.23.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	nucleR_2.23.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/诊断
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/nucleR/
包下载报告	下载数据